Question:
对于使用qPCR的基因检测,如果做方法验证,需要至少验证哪些内容?什么时候需要做全验证?什么时候做部分验证?具体遵循什么法规/指导原则?
Answer:
关于qPCR基因检测的方法验证内容,需首先确认是使用有证试剂盒(如CE approved),还是LDT(Laboratory Developed Test, 实验室自主研发试剂盒)或修改有证试剂盒的方法:
对于有证试剂盒:主要参考试剂盒说明书的参数说明,至少包括精密度、准确度和可报告范围(荧光定量PCR,例如HBV DNA需要做AMR,即Analytical Measurement Range 检测范围)。注:对于定性检测,国内临检中心一般会要求加做LOD (Limit of Detection分析灵敏度)。
对于LDT或修改有证试剂盒的方法验证需包括:精密度、准确度、可报告范围、分析灵敏度(LOD)、分析特异性(干扰因素和交叉反应)、以及其它可能影响检测性能的参数,例如稳定性、参考范围、携带污染等。
在检验程序常规应用前和检测流程更改时的重大更新(例如更改了检测设备、PCR方法学、PCR试剂等影响检测原理的重大更新)需要进行全验证;对于检测流程更改的非重大更新(例如更换了相同原理的抽提试剂等)和发生任何严重影响检测系统分析性能的情况发生后(如仪器主要部件故障,仪器搬迁,设施环境严重失控等),需对受影响的性能进行部分性能验证。实验室主任或者技术主管需要对更新以及所采取的措施进行评价,形成相应的书面指导意见。
参考文件:
CNAS-GL039: 2019《分子诊断检验程序性能验证指南》
WST 505—2017《定性测定性能评价指南》
CAP All Common Checklist